如何在Linux（Red Hat/CentOS）上更新到特定的R版本，同时保留先前的版本？

也许一个更准确的标题应该是：“如何从原地（EPEL）R切换到并行（版本特定）的Linux（Red Hat/CentOS）上的R安装？”

一个（可能典型的）Linux上升级R的故事...

历史：

在过去的某个时刻，我使用默认版本更新了我们的RHEL/CentOS 7服务器上的R版本，当时使用的是yum软件包管理器提供的默认版本。例如，在2019年初的某个时候，我通过sudo yum install R将版本升级到了3.5.2。默认情况下，这会将R安装在/usr/lib64/R目录下，供所有用户使用，并完全替换之前安装在此位置的3.4.x版本。Shiny Server已经安装并配置为以shiny用户运行，它顺利地使用了新版本的R。

情况：

一年后，现在是时候决定更新Linux服务器上运行的R版本了。运行yum check-upgrade R命令，我发现可用的版本是3.6.0。实际上，我想要安装的是3.6.3，并且我不想破坏正在使用3.5.2的所有应用程序，所以我需要使用另一种方法。按照https://docs.rstudio.com/resources/install-r/中的说明，我下载了3.6.3的.rpm文件并进行了安装。默认情况下，这会将R安装在/opt/R/3.6.3/目录下，同时保留3.5.2版本。然而，当我完成创建R的符号链接步骤后，我的所有shiny应用程序都无法工作：

sudo ln -s /opt/R/3.6.3/bin/R /usr/local/bin/R
sudo ln -s /opt/R/3.6.3/bin/Rscript /usr/local/bin/Rscript

这并不令人惊讶。我的shiny应用程序都依赖于几个尚未安装到这个新版本R中的R包。为了让我的应用程序在之前的版本（3.5.2）上重新工作，我需要在安装新版本的必要包之前删除这些符号链接：

sudo rm /usr/local/bin/R
sudo rm /usr/local/bin/Rscript

我的shiny应用程序日志文件（位于/var/log/shiny-server/--.log）中的错误消息证实了由于缺少包而导致应用程序启动失败。为了更新共享库文件夹中的R包，我需要以sudo身份运行新版本的R：sudo -i /opt/R/3.6.3/bin/R，然后在R中安装必要的包，例如install.packages(c("shiny","devtools","rmarkdown","shinydashboard","tidyverse"))。

现在R包已经安装完成，我可以重新创建符号链接：

sudo ln -s /opt/R/3.6.3/bin/R /usr/local/bin/R
sudo ln -s /opt/R/3.6.3/bin/Rscript /usr/local/bin/Rscript

我验证了我的应用程序在新版本的R上是否正常工作。

现在我有一些问题：

问题1：完成这些步骤后，R --version仍然返回旧版本（3.5.2）。但是第二天我再次登录时，它打开的是3.6.3版本。为什么？我需要运行一个终端命令来立即获取新版本的R --version，还是只能通过打开一个新的终端窗口来实现这一点？

问题2：运行sudo R --version总是返回旧版本（3.5.2）。运行sudo which R返回/bin/R。运行more /bin/R显示的内容表明它是一个“用于R可执行文件的Shell包装器”，并且硬编码了“/usr/lib64/R”路径。我认为在这一点上我不需要这个包装器。如何推荐让这些sudo命令指向新版本？

我可以在我的主目录中备份该文件（例如，cp /bin/R ~/binR.backup），以防万一，然后：

• 删除/bin/R？
• 用新版本创建一个指向/bin/R的符号链接（例如，sudo ln -s /opt/R/3.6.3/bin/R /bin/R）？
• 使用与安装3.6.3相同的方式将“旧”版本重新安装到/opt/R/3.5.2/中，安装包，并然后删除/usr/lib64/R版本（例如，sudo yum remove R）？

我看到了一些类似的问题，但没有回答我的问题的链接：

1. 如何在Linux上升级R
2. 更改Linux中的路径
3. 如何在Linux中加载特定版本的R