从这段内容中可以看出，问题的出现原因是希望从Git仓库中提取树（tree），即将指定分支的指定目录提取出来。解决方法是使用read-tree和checkout-index命令来完成，需要使用临时的索引文件。

具体的解决方法如下：

1. 对于非裸仓库，可以使用以下命令：

GIT_INDEX_FILE=.tmp.index { git read-tree master:src &&
                            git checkout-index -a --prefix=dest/; 
                            rm -f .tmp.index; }

这个命令将指定分支（master）的指定目录（src）读取到临时索引文件中，然后使用checkout-index命令将索引文件中的内容检出到指定目录（dest/），最后删除临时索引文件。

2. 对于裸仓库，需要假装存在一个工作树，并在其中进行操作。可以使用以下命令：

GIT_INDEX_FILE=.tmp.index GIT_DIR=/path/to/repo.git GIT_WORK_TREE=. {
    git read-tree master:src &&
    git checkout-index -a --prefix=/path/to/dest/; 
    rm -f .tmp.index; }

这个命令与前一个命令类似，只是在执行之前设置了一些环境变量，指定了裸仓库的路径和工作树的路径。

需要注意的是，如果在裸仓库中运行这个命令，则不需要设置GIT_DIR。

这个解决方法相对于使用git archive命令的优势是更底层，更接近Git的内部操作。至于性能上的差异，作者并不确定，因此将两种方法分开提供，希望知道哪种方法更受欢迎。

另外，有评论指出，在裸仓库中使用Git 1.7.0.4版本时，"git checkout-index"步骤会失败并显示"fatal: This operation must be run in a work tree"错误。因此，对于裸仓库的情况，更推荐使用另一种方法。

还有一些评论提到了一些细节问题，例如环境变量的导出和路径的设置，对此作者并不太喜欢建议导出GIT_*环境变量，因为有可能忘记取消设置并造成问题。有人建议将这些细节作为另一个答案来提供。作者也对此进行了一些回应和修改。

这篇文章介绍了如何从Git仓库中提取树的最佳方法，包括了针对非裸仓库和裸仓库的解决方法，并讨论了一些细节和问题。

在使用git仓库时，有时候需要从中提取出一个特定的树（tree）。出现这个问题的原因可能是希望获取特定的文件或文件夹，或者需要将树导出到另一个地方进行进一步的分析或处理。

解决这个问题的一个方法是使用一个脚本来解析git ls-tree -r -z <tree-ish>命令的输出。这个脚本可以通过解析git ls-tree命令的输出来提取出树的内容。可以将任何git ls-tree命令可以理解的树传递给脚本，例如：

extract-tree-from-git.py master:src/tests/ /tmp/extracted-tests/
extract-tree-from-git.py HEAD^ /tmp/parent-of-head/

这个脚本可以通过解析git ls-tree命令的输出来提取出树的内容，并将其保存到指定的位置。这样就能够从git仓库中提取出特定的树了。

"从git存储库中提取树的最佳方法是什么？"这个问题的出现的原因以及解决方法。

问题的出现原因：

在使用git存储库时，有时候需要从存储库中提取一个特定的树结构（tree）。然而，如何高效地实现这个目标可能不是那么明确。因此，有人提出了这个问题，希望能找到最佳的方法来从git存储库中提取树。

解决方法：

可以使用git的git archive命令来实现这个目标。具体步骤如下：

git archive master:src/ | tar -C destination -x

这个方法非常简洁高效，比起使用脚本实现要快得多。另外，使用这个方法还有一个额外的好处，就是可以远程提取树结构，即可以针对另一个（甚至是裸的）存储库使用--remote参数来实现。

最终，通过上述的解决方法，我们可以高效地从git存储库中提取树结构。