你不需要将子模块添加到.gitignore文件中：父模块会以一个gitlink（一种特殊的条目，mode为160000）的形式看到子模块。这意味着：在子模块中直接进行的任何更改都需要在父目录中进行提交。这样，父目录将记录子模块状态的正确提交：该提交就是上述提到的gitlink。

子模块的主要思想是一种基于组件的方法，其中你可以在特定提交上引用其他仓库。但是，如果你在这些子模块中进行任何更改，你也需要在父仓库中更新这些引用。

注意，从Git 2.13开始（2017年第二季度），尽管没有将gitlink忽略掉，你仍然可以通过以下方式忽略子模块：

git config submodule..active false

更多信息请参见"忽略git子模块的新提交"。

需要注意的是，从Git 2.15.x/2.16开始（2018年第一季度），忽略子模块的方式更加精确。`git status --ignored --untracked`不再停留在被忽略的目录的工作树上，而是列出该目录中的文件，而不仅仅是显示被忽略的目录本身。

在这个问题中，某些情况下了将.gitmodules文件添加到.gitignore中的原因。这是因为.gitmodules文件中可能包含一个包含用户名参数的用户特定git URL。然而，这个问题（以及我的答案）是关于是否忽略子模块文件夹本身（用gitlink表示的文件夹）的问题，而不是忽略.gitmodules文件。.gitmodules文件确实可能包含凭据，但如果仅用于克隆公共仓库，它不必包含凭据。此外，它们可以在Windows上使用凭据助手（如"Git Credential Manager for Windows"）进行缓存，所以在.gitmodules中存储凭据并不是必须的。

是否将git submodule添加到.gitignore中取决于你的实际需求和安全考虑。如果你希望子模块的更改自动跟踪并提交到父仓库中，那么不需要将其添加到.gitignore中。如果你希望忽略子模块的更改，可以通过配置命令来实现。

在这个问题中，出现的原因是将Git子模块文件夹添加到.gitignore文件中会导致问题，特别是在尝试创建项目的新克隆时。具体来说，运行常规的子模块克隆命令会导致子模块文件夹为空：

git submodule init
git submodule update
git pull --recurse-submodules

只有重新运行

git submodule add  

根据输出的结果，才能清楚地知道问题所在：

The following path is ignored by one of your .gitignore files:

Use -f if you really want to add it.

我删除了.gitignore中的Git子模块文件夹，并重新运行了子模块克隆命令，现在成功创建了该文件夹。我认为可能存在一个bug，即其中一个子模块克隆命令遵循了.gitignore，但没有相应地警告它跳过了一个子模块。

解决方法是从.gitignore中删除Git子模块文件夹，然后重新运行子模块克隆命令即可。