问题的原因：在资源文件夹中创建了一个名为"dominion.application"的文件夹，而不是在一个名为"dominion"的文件夹内创建一个名为"application"的文件夹。由于这个原因，"MainController"类被放置在与fxml文件不同的包中。

解决方法：

1. 打开操作系统中的资源文件夹。

2. 在资源文件夹中创建一个名为"dominion"的文件夹。

3. 在"dominion"文件夹中创建一个名为"application"的文件夹。

4. 将"MainController"类移动到"dominion.application"包中。

5. 确保"MainController"类和fxml文件位于同一个包中。

这样做将解决"如何在资源文件夹中引用JavaFX FXML文件"的问题。

问题的原因是在加载FXML文件时，使用了相对路径，但是FXML文件和加载它的Java类不在同一个目录下。解决方法是使用相对路径，并在加载FXML文件的路径前加上"/"字符。例如，可以使用以下代码解决问题：

FXMLLoader fxmlLoader = new FXMLLoader( getClass().getResource("/main.fxml") );

这个解决方法非常简单，一旦你仔细考虑一下，就会明白它的道理。路径是相对于调用FXMLLoader()方法的源文件的。

问题的出现原因：

该问题的出现是由于在JavaFX应用程序中引用FXML文件时出现了路径错误或资源文件无法找到的问题。

解决方法：

以下是解决该问题的几种方法：

1. 将所有的FXML文件放在src/main/resources目录下，并使用以下代码引用：

loader.setLocation(getClass().getResource("/main.fxml"));

2. 将所有的FXML文件放在src/main/resources/fxml目录下，并使用以下代码引用：

loader.setLocation(getClass().getResource("/fxml/main.fxml"));

3. 将FXML文件放在对应的资源目录中，例如src/main/resources/com/mycompany/myapp，并使用以下代码引用：

loader.setLocation(getClass().getResource("main.fxml"));

最后一种方法假设加载FXML的类与对应的Java源代码层次结构中的相对位置相同。例如，您可能会从源代码com/mycompany/myapp/Main.java中调用最后一个加载命令。

建议使用FXMLLoader的用法：

1. 实例化FXMLLoader时使用new FXMLLoader()，而不是使用FXMLLoader上的静态方法。

2. 在实例化的FXMLLoader上设置位置并调用load()，而不是使用流加载。

3. 要根据类获得位置，请使用getClass().getResource()，而不是getClass().getResourceAsStream()。

IDE和构建设置：

确保您的IDE或构建工具将FXML文件从资源目录复制到构建输出目录。有关此设置的Intellij设置，请参见文章中提供的链接。

关于Java Jigsaw模块化应用程序的说明：

在Java Jigsaw模块化应用程序中，需要注意资源的获取方式。具体来说，应该从类直接获取资源，而不是从类加载器获取。如果从类加载器获取资源，那么根据模块配置，查找将受到额外限制。

对于NetBeans用户的快速提示：

如果您使用的是NetBeans，可以通过右键单击项目目录 > 属性 > 选择“源” > 选择要添加到源的文件夹 > 添加文件夹 来将现有文件夹添加到src目录。因此，如果您已经有一个包含您要引用的FXML文件的文件夹，您可以直接将该文件夹添加并使用相对路径调用FXML文件。

以上是关于如何在JavaFX应用程序中引用FXML文件的解决方法和一些建议。希望能对您有所帮助！