操纵非常大的文本文件和聚类分析

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操纵非常大的文本文件和聚类分析

我试图处理一个(非常)大的45GB的.txt文件,无法使用普通的文本编辑器打开。\n每行数据之间用空格分隔,尽管每个参数内部也有空格。例如,一行看起来有点像这样:\n

\n剑桥大学CB2 1TQ 0001234567 2011-01-25 12345 11.12345\n 12.12345 13.12345 14.1234 16.2716)\n

\n我想要的是清理它,过滤一些数据,对一些单元格/参数进行求和,将一些附加数据追加到每行,并进行聚类分析(可能使用Python或C#,因为我开始学习它)。

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大规模文本文件的处理和聚类分析是一个问题,可能出现的原因是文本文件的大小超过了常规处理方法的限制。解决这个问题的方法是将数据存储到数据库中,并使用数据库执行查询操作,以更高效的方式获取聚合统计数据和附加值。可以使用Python的标准库中的DB API,如sqlite3,也可以使用ORM库如SQLAlchemy。此外,还可以使用公共云数据库的SDK,如AWS的boto3和Google Cloud的Cloud SQL。

下面是一个示例代码,展示了如何将文本文件中的数据存储到数据库中:

with open("file.txt", "r") as file:
    for line in file:
        # 过滤数据
        # 如果数据通过过滤,将其添加到批处理中
        # 当批处理大小达到n时,将数据插入到数据库中并重新开始批处理

通过将数据存储到数据库中,可以更方便地执行各种SQL查询操作,获取聚合统计数据、追加值等。可以从数据库中提取样本用于机器学习操作,也可以使用支持查询的`fit generator`方法。Python的scikit-learn库提供了聚类算法的实现,但是没有针对大规模数据的内存外实现。至于C#库,由于没有使用过,无法发表意见。

总之,通过将大规模文本文件存储到数据库中,并使用数据库查询来处理和分析数据,可以解决大规模文本文件处理和聚类分析的问题。Python提供了许多数据库相关的工具和库,可以方便地进行操作。

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