从VS 2003以来，我就没有再使用过Web应用程序了。网站项目现在拥有所有的功能：母版页，用于组织网站内容的文件夹（例如App_Data，App_Themes等），以及站点地图文件。自从微软在VS中引入了Cassini作为内置的Web容器进行调试后，使用网站变得更加容易了。

然而，有些人可能仍然喜欢使用Web应用程序的一些特性，例如强类型视图和预编译的代码文件。这些功能在Web应用程序中更加易于实现。因此，一些开发人员可能会面临选择使用VS 2008的ASP.NET网站还是Web应用程序的问题。

对于那些喜欢网站项目的人来说，他们可能会发现这个问题并没有什么解决办法。他们可以继续使用网站项目，因为它们提供了很多功能，可以满足他们的需求。

对于那些更喜欢Web应用程序的人来说，他们可以考虑转换项目类型。转换项目类型可以在VS 2008中完成。以下是转换项目类型的步骤：

1. 打开VS 2008并加载您的网站项目。

2. 在“解决方案资源管理器”中，右键单击项目并选择“转换为Web应用程序”。

3. 确认转换操作，并等待VS 2008将您的项目转换为Web应用程序。

转换完成后，您的项目将具有Web应用程序的特性，并且您可以继续开发和调试。

VS 2008提供了两种不同类型的ASP.NET项目：网站和Web应用程序。选择哪种类型取决于开发人员的个人偏好和项目需求。对于那些更喜欢网站项目的人来说，他们可以继续使用它们并享受所有的功能。对于那些更喜欢Web应用程序的人来说，他们可以通过转换项目类型来获得所需的特性。无论选择哪种类型，VS 2008都提供了强大的开发工具，可以帮助开发人员构建出色的ASP.NET应用程序。

VS2008中出现了ASP.NET Website和Web Application两种开发模型。这是因为在VS2005中引入了Web Site模型，取代了更像现在的Web Application模型的VS2003 Web Site模型。而Web Application模型是后来作为附加组件发布的，自VS2008以来，它成为了Visual Studio的常规部分。

至于两种模型的优势和差异，请参阅许多类似/重复的问题（https://stackoverflow.com/search?q=website web application）和尤其是这个回答，其中有一个很好的总结：ASP.NET Web Site or ASP.NET Web Application?（https://stackoverflow.com/questions/398037/398049#398049）

根据这个回答的总结，下面是ASP.NET Website和Web Application这两种模型的主要区别：

1. 文件结构：

- Web Site模型：以文件夹的形式组织项目，每个文件夹都被视为一个命名空间。

- Web Application模型：以项目文件（.csproj或.vbproj）的形式组织项目，项目文件定义了项目的结构、引用和编译选项。

2. 部署方式：

- Web Site模型：在发布时，将整个项目文件夹复制到服务器上。

- Web Application模型：将项目编译为一个或多个程序集（.dll文件）和相关资源文件，然后将它们部署到服务器上。

3. 编译方式：

- Web Site模型：动态编译，每次访问页面时都会重新编译页面和代码文件。

- Web Application模型：预编译，将项目编译为一个或多个程序集，减少了每次访问时的编译时间。

4. 命名空间和引用：

- Web Site模型：不需要显式添加命名空间和引用，可以直接使用其他页面和代码文件中的类和变量。

- Web Application模型：需要显式添加命名空间和引用，以便在代码中使用其他页面和代码文件中的类和变量。

5. 更新和版本控制：

- Web Site模型：可以通过直接编辑项目文件夹中的文件来更新项目，不需要重新编译和部署整个项目。

- Web Application模型：需要重新编译和部署整个项目来更新。

ASP.NET Web Site模型适用于小型项目和快速原型开发，它更加灵活和容易上手。而ASP.NET Web Application模型适用于大型项目和团队开发，它更加严格和可控，有利于代码的组织和维护。

希望这个总结能帮助你理解并选择适合你项目需求的开发模型。