如何使Python包在代码中更新以实时生效

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如何使Python包在代码中更新以实时生效

我有以下代码行：\n

from pip import main as pipmain
# 初始安装
pipmain(["install", "pyscenic==0.10.0"])
import pyscenic
pyscenic.__version__
# 返回0.10.0
# 这里有一些庞大的代码
# 第二次安装
pipmain(["install", "install", "pyscenic==0.10.4"])
import pyscenic
pyscenic.__version__
# 仍然返回0.10.0
# 另一个需要新版本的庞大代码块

\n在这里，我想在我的代码中即时升级pyscenic软件包。\n然而，如我上面所述，在第二次安装中版本仍然没有改变。\n我期望它改变为0.10.4。我该如何正确地做到这一点？\n我也尝试了这个，仍然没有效果：\n

import os
import importlib
os.system('pip install pyscenic==0.10.0')
import pyscenic
pyscenic.__version__
os.system('pip install pyscenic==0.10.4')
import pyscenic
pyscenic.__version__
importlib.reload(pyscenic)
pyscenic.__version__

\n所有代码在IPython（交互式）上测试。\n如果我退出IPython并重新进入，它将生效。\n但这不是我想要的。

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3 答案

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问题的原因是：需要在代码中更新Python包以便实时生效，但目前的方法无法实现这一点。

解决方法是：编写一个bash文件，在两个Python文件之间按顺序运行，使用pip在两个Python运行之间更改pyscenic包的版本。可以像下面这样实现：

#!/usr/bin/env bash
pip install pyscenic==0.10.0
python first_script.py
pip install pyscenic==0.10.4
python second_script.py

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问题：

如何在代码中使Python包更新以实时生效？

原因：

在脚本内部安装包不是首选的安装包方式。大多数包即使更新后，仍具有旧版本中的所有功能，而且由于您的版本更改很小，不应该产生太多问题。

但是，如果您想在脚本内部安装包，可以使用os.system，但在安装其他版本之前，首先删除先前的版本，然后您就可以进行安装了。

如果这不能解决您的问题，您可以查看下面的代码。这应该解决在脚本内安装和卸载包的问题。

解决方法：

import subprocess
import sys
def install(package):
    subprocess.check_call([sys.executable, "-m", "pip", "install", package])
def uninstall(package):
    subprocess.check_call([sys.executable, "-m", "pip", "uninstall", package])

他可以使用install函数安装指定版本的包，然后使用uninstall函数卸载它，然后安装同一包的其他版本。

请告诉我是否有效。

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如前面的回答和最近的请求所提到的，pip和Python并没有真正考虑到这一点。但是通过对Python的名称系统进行一些巧妙的黑客攻击，并且了解您想要使用的软件包，您可以在一起安装两个版本。

这个Bash脚本克隆了存储库两次，分别检出版本0.10.0和0.10.4，通过sed进行一些重命名，最后安装了两个名为pyscenic100和pyscenic104的库。

# 版权所有  2021 Alexander L. Hayes
# MIT许可证
git clone git.com:aertslab/pySCENIC pySCENIC100
git clone git.com:aertslab/pySCENIC pySCENIC104
(
  cd pySCENIC100
  git checkout 0.10.0
  sed -i "s/pyscenic/pyscenic100/g" setup.py
  sed -i "s/pyscenic/pyscenic100/g" MANIFEST.in
  sed -i "s/pyscenic/pyscenic100/g" setup.cfg
  (
    cd src
    mv pyscenic pyscenic100
    (
      cd pyscenic100
      sed -i "s/pyscenic/pyscenic100/g" binarization.py
      sed -i "s/pyscenic/pyscenic100/g" __init__.py
      sed -i "s/pyscenic/pyscenic100/g" _version.py
    )
  )
  python setup.py install
)
(
  cd pySCENIC104
  git checkout 0.10.4
  sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" setup.py
  sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" MANIFEST.in
  sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" setup.cfg
  (
    cd src
    mv pyscenic pyscenic104
    (
      cd pyscenic104
      sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" binarization.py
      sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" __init__.py
      sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" _version.py
      (
        cd cli
        sed -i "s/pyscenic/pyscenic104/g" *.py
      )
    )
  )
  python setup.py install
)

这个脚本克隆存储库两次，检出版本0.10.0和0.10.4，通过sed进行一些重命名，并最终安装了两个名为pyscenic100和pyscenic104的库。

import pyscenic100
import pyscenic104
print(pyscenic100.__version__)
print(pyscenic104.__version__)
# 0.10.0+0.g3de37cb.dirty
# 0.10.4+0.g436561f.dirty

我不知道在“# Some large code here”中发生了什么，但它看起来像是文档/测试的示例可以工作。

from pyscenic100.featureseq import Feature as Feature100
from pyscenic104.featureseq import Feature as Feature104
f1 = Feature100.from_string('chr1 12 50 feature1 10.0 +')
f2 = Feature100.from_string('chr1 40 60 feature2 10.0 -')
print(f1.has_overlap_with(f2))
# True
f1 = Feature104.from_string('chr1 12 50 feature1 10.0 +')
f2 = Feature104.from_string('chr1 40 60 feature2 10.0 -')
print(f1.has_overlap_with(f2))
# True

这段代码导入了pyscenic100和pyscenic104两个版本的库，并成功地运行了一些示例代码。

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